Một biến chứng hiếm gặp của bệnh là chuột rút cơ bắp, loãng xương, suy dinh dưỡng cấp tính và rõ ràng với phình và cổ trướng ở các chi. Bệnh có thể ảnh hưởng đến hệ thần kinh một cách không rõ dẫn đến tê liệt chân tay do mất điều hòa não do vôi hóa trong tiểu não, và các bệnh liên quan, mà các bác sĩ đã nhận thấy ở bệnh nhân không dung nạp lúa mì nhiều hơn những người khác bị dị ứng và bệnh tự miễn , bao gồm bệnh Hashimoto ảnh hưởng đến tuyến giáp và bệnh tiểu đường loại I và bệnh Schugren, và các bệnh liên quan cũng như bệnh viêm ruột, bệnh gan mãn tính, động kinh và xơ gan mật nguyên phát
Thiếu kháng sinh cũng phổ biến hơn ở những người bị dị ứng lúa mì và các biến chứng lâu dài của bệnh loãng xương xảy ra ngay cả ở những bệnh nhân tuân thủ thực phẩm không chứa gluten.